新藥研發(fā)是一座風(fēng)光無(wú)限的險(xiǎn)峰，今天，征服這座險(xiǎn)峰的關(guān)鍵節(jié)點(diǎn)出現(xiàn)了。10月29日，深勢(shì)科技在上海重磅發(fā)布新一代藥物計(jì)算設(shè)計(jì)平臺(tái)Hermite®，Hermite®致力于為藥物研發(fā)工作者提供在CADD中數(shù)據(jù)、算法、算力三位一體的一站式解決方案。作為AI for Science的引領(lǐng)者和踐行者，深勢(shì)科技高舉AI for Science的旗幟，開(kāi)創(chuàng)性的提出“多尺度建模+機(jī)器學(xué)習(xí)+高性能計(jì)算”的科學(xué)研究新范式，打造了新一代人工智能分子模擬平臺(tái)。

發(fā)布會(huì)上，深勢(shì)披露了關(guān)于Hermite®平臺(tái)的諸多細(xì)節(jié)優(yōu)勢(shì)。基于AI、物理建模、高性能計(jì)算的Hermite®，在小分子藥物設(shè)計(jì)領(lǐng)域的核心功能包括：

UniFold-蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)與優(yōu)化；

Uni Docking-苗頭化合物的超高通量虛擬篩選；

Uni IFD-藥靶結(jié)合模式的精確預(yù)測(cè)；

Uni FEP-基于自由能微擾的先導(dǎo)化合物優(yōu)化。

首先，基于深度學(xué)習(xí)方法，Uni-Fold可以快速準(zhǔn)確、動(dòng)態(tài)的預(yù)測(cè)蛋白三維結(jié)構(gòu)。還能快速預(yù)測(cè)超大對(duì)稱蛋白高聚體，通過(guò)開(kāi)源代碼、參數(shù)和數(shù)據(jù)集，Uni-Fold較以往平臺(tái)訓(xùn)練時(shí)間至少可以減少50%，復(fù)合蛋白預(yù)測(cè)精度至少提升15%。

其次，Uni-Docking是GPU極致加速的分子對(duì)接引擎。在保持篩選精度的前提下，將千萬(wàn)級(jí)分子數(shù)據(jù)庫(kù)的虛擬篩選推入可及、可用、可靠的時(shí)代。與MM GB/PBSA組成虛擬篩選工作流后，準(zhǔn)確性進(jìn)一步得到提升。

再次，通過(guò)模擬藥物分子與靶點(diǎn)結(jié)合產(chǎn)生的“誘導(dǎo)契合”效應(yīng)，Uni-IFD可以精確預(yù)測(cè)藥物與靶點(diǎn)的結(jié)合模式。同時(shí)，Uni-Aquasite可以通過(guò)計(jì)算得到每個(gè)水分子的自由能，尋找對(duì)藥靶結(jié)合影響較大的水分子。

此外，Uni-FEP基于自由能微擾理論、分子動(dòng)力學(xué)、增強(qiáng)采樣算法，以化學(xué)精度高效評(píng)估蛋白質(zhì)與配體的結(jié)合親和能。同時(shí)，Uni-FEP擁有友好的交互界面和流程，多維度多次計(jì)算的整合分析讓其成為藥化科學(xué)家身邊的Assay計(jì)算工具。

值得注意的是，Hermite®為藥物研發(fā)科學(xué)家打造了基于瀏覽器的全新體驗(yàn)，包括可視化、結(jié)構(gòu)化分子，最大化操作區(qū)域，靈活調(diào)整窗口，跨窗口智能化協(xié)作，這就是Hermite®，作為藥物研發(fā)科學(xué)家的手、眼、腦，加速藥物發(fā)現(xiàn)，降低研發(fā)成本，發(fā)現(xiàn)顛覆性創(chuàng)新分子實(shí)體。

這一切變革的背后，是Hermite®在底層科學(xué)算法的創(chuàng)新，為每一個(gè)藥物發(fā)現(xiàn)提供設(shè)計(jì)靈感和計(jì)算動(dòng)力。

圖為：中科院院士，北京科學(xué)智能研究院院長(zhǎng)，深勢(shì)科技首席科學(xué)顧問(wèn)鄂維南致辭

發(fā)布會(huì)上，中科院院士，北京科學(xué)智能研究院院長(zhǎng)，深勢(shì)科技首席科學(xué)顧問(wèn)鄂維南致辭表示：Hermite®是“AI forScience從算法創(chuàng)新到應(yīng)用落地的里程碑實(shí)踐和代表產(chǎn)品”。鄂維南指出，AI for Science研究范式的出現(xiàn)是科技創(chuàng)新的一個(gè)重要?dú)v史機(jī)遇。他不僅拓展了數(shù)據(jù)驅(qū)動(dòng)、物理模型驅(qū)動(dòng)模式的能力邊界，還有望推動(dòng)二者的有機(jī)結(jié)合，為進(jìn)一步解決實(shí)際問(wèn)題提供理論基礎(chǔ)。同時(shí)AI for Science也極大的拉近了科學(xué)研究與實(shí)際應(yīng)用的距離。鄂維南強(qiáng)調(diào)，實(shí)現(xiàn)創(chuàng)新-落地閉環(huán)，既不能靠一廂情愿、也不是一蹴而就、更不會(huì)一勞永逸。實(shí)現(xiàn)創(chuàng)新-落地閉環(huán)要面向產(chǎn)業(yè)界的真需求，解決需求背后科學(xué)、工程上的真問(wèn)題，要各方面的人不斷交流和碰撞。

面對(duì)AI for Science從算法創(chuàng)新到應(yīng)用落地的進(jìn)一步實(shí)現(xiàn)，深勢(shì)科技創(chuàng)始人兼CEO孫偉杰在歡迎辭中表示：選擇Hermite®，是選擇與新時(shí)代接軌。孫偉杰針對(duì)當(dāng)前科學(xué)實(shí)驗(yàn)中遇到的問(wèn)題，特別提出了科學(xué)實(shí)驗(yàn)算法的分級(jí)理論，即如何對(duì)算法設(shè)定合理的期望，怎樣的算法是可以大規(guī)模替代實(shí)驗(yàn)的工業(yè)級(jí)算法。

圖為：深勢(shì)科技創(chuàng)始人兼CEO孫偉杰進(jìn)行分享

他將算法分為L(zhǎng)1至L3三個(gè)級(jí)別：L1為模仿現(xiàn)實(shí)，即對(duì)實(shí)驗(yàn)結(jié)果的復(fù)制和外推；L2為預(yù)測(cè)現(xiàn)實(shí)，對(duì)現(xiàn)象的預(yù)測(cè)接近實(shí)驗(yàn)精度，并有可預(yù)期的誤差范圍；L3為搜索現(xiàn)實(shí)，這就要求能夠準(zhǔn)確預(yù)測(cè)現(xiàn)象，并能從空間中直接搜索最佳結(jié)果。當(dāng)前，對(duì)于化學(xué)、生物、材料、藥物等實(shí)驗(yàn)學(xué)科，并不一定追求百分之百準(zhǔn)確的算法，只要能夠大幅縮小實(shí)驗(yàn)誤差，明確精度邊界，就可以大規(guī)模的替代此前的實(shí)驗(yàn)?zāi)Ｊ剑源笠?guī)模推廣L2級(jí)別，積極發(fā)展L3級(jí)別的算法，將引領(lǐng)未來(lái)實(shí)驗(yàn)科學(xué)算法的前進(jìn)方向。

從現(xiàn)在到2025年的核心目標(biāo)，是在藥物研發(fā)的各個(gè)環(huán)節(jié)打造一系列能夠規(guī)模化替代實(shí)驗(yàn)的工業(yè)級(jí)算法，把以經(jīng)驗(yàn)驅(qū)動(dòng)的實(shí)驗(yàn)試錯(cuò)模式轉(zhuǎn)變?yōu)?ldquo;計(jì)算設(shè)計(jì)-實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證”的理性迭代模式。而Hermite®充分利用云計(jì)算時(shí)代軟件功能特點(diǎn)和優(yōu)勢(shì)，在基礎(chǔ)設(shè)施快速建設(shè)和發(fā)展的時(shí)代，能夠幫助用戶持續(xù)觸達(dá)最前沿的藥物設(shè)計(jì)算法，并以星期為單位不斷升級(jí)產(chǎn)品使用體驗(yàn)，選擇Hermite®，就是選擇了持續(xù)進(jìn)化。

圖為：深勢(shì)科技創(chuàng)始人兼首席科學(xué)家張林峰做算法成果分享

深勢(shì)科技產(chǎn)品的不斷進(jìn)階和卓越，正是依靠了背后強(qiáng)大的算法工程體系支撐。深勢(shì)科技創(chuàng)始人兼首席科學(xué)家張林峰在解析底層算法成果的分享中指出：前沿算法的開(kāi)發(fā)并不只是做demo、發(fā)paper那么簡(jiǎn)單，還需要大量的算法工程比如數(shù)據(jù)工程、硬件適配、性能優(yōu)化，跟云計(jì)算的結(jié)合也需要有大規(guī)模、高復(fù)雜度系統(tǒng)建設(shè)的能力體系；更重要的是，軟件不是開(kāi)發(fā)出來(lái)的而是被用出來(lái)的，發(fā)布上線只是個(gè)開(kāi)始，以需求和反饋為導(dǎo)向持續(xù)優(yōu)化才是工業(yè)軟件的真正壁壘。工業(yè)軟件是“物理內(nèi)核+工程體系+研發(fā)經(jīng)驗(yàn)”緊密結(jié)合的行業(yè)智慧結(jié)晶，一路走來(lái)，深勢(shì)科技已經(jīng)集結(jié)了從理論發(fā)展、算法攻堅(jiān)、大規(guī)模工程建設(shè)到行業(yè)研發(fā)的一體化頂尖團(tuán)隊(duì)，未來(lái)更有信心為行業(yè)提供高效穩(wěn)定、能打勝仗的解決方案。

當(dāng)AI與生命科學(xué)發(fā)生鏈接，豐富的AI工具將人工智能和物理建模相融合，開(kāi)啟AI for Science的新篇章。用計(jì)算突破藥物設(shè)計(jì)，解決復(fù)雜場(chǎng)景下的科學(xué)難題。Hermite®不僅是深勢(shì)科技近年來(lái)在AI for Science領(lǐng)域深耕和集大成的優(yōu)秀作品，也是深勢(shì)科技伙伴們共同的杰作。例如，火山引擎為深勢(shì)科技提供了基于GPU加速的科學(xué)計(jì)算解決方案，除了提供極具性價(jià)比的高性能算力和一站式AI開(kāi)發(fā)平臺(tái)，還可以根據(jù)業(yè)務(wù)流量自動(dòng)彈性擴(kuò)縮容，實(shí)現(xiàn)節(jié)點(diǎn)自愈等策略的智能運(yùn)維。惠普則通過(guò)其Z系列數(shù)據(jù)科學(xué)工作站 Zbook Firefly14 G8，為深勢(shì)提供更加穩(wěn)定的服務(wù)。深勢(shì)始終相信：成就伙伴，引領(lǐng)創(chuàng)新。沒(méi)有產(chǎn)業(yè)鏈上每一個(gè)環(huán)節(jié)的緊扣，沒(méi)有行業(yè)合作者間的攜手，就無(wú)法了解需求、完善產(chǎn)品、不斷創(chuàng)新。

一場(chǎng)名為AI for Science的新科技革命正在悄然征服包括新藥研發(fā)在內(nèi)的多座險(xiǎn)峰。促進(jìn)AI與生命科學(xué)、藥物研發(fā)等等領(lǐng)域的深度融合，AI for Science帶來(lái)的豐富研究工具和方法，正引領(lǐng)著科學(xué)研究領(lǐng)域新范式的大踏步進(jìn)階。

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